L'ISCOT Liguria si articola in dipartimenti, con specifiche banche d'intervento:

la ricerca
la formazione
la consulenza

Alle attività di ogni dipartimento partecipano formatori e consulenti selezionati in base all'esperienza nei settori interessati, integrati in gruppi di lavoro consolidati.
Un'organizzazione di questo genere presenta alcuni rilevanti vantaggi:

- una maggiore flessibilità operativa, che significa autonomia rispetto alle possibili evoluzioni congiunturali;
- la possibilità di attivare di volta in volta gli specialisti necessari alle specifiche tematiche in oggetto
- il coinvolgimento di professionisti legati all'universo aziendale, in grado di apportare esperienze dirette dal mondo imprenditoriale e del lavoro;
- un approccio interdisciplinare ai problemi, grazie alla presenza conginta di professionalità diversificate